| イベント | 場所 | 発生条件、補足事項 |
| パシ研みんなの将来の夢 | 自動 | ５章開始イベント →サーベイハバナス街の探索が可能に →サーベイハバナス街の迷宮に入れるように |
| テロリストの残党に襲われる | サーベイハバナス街の迷宮クリア時 | CG5-1:バックファイア出現、CG5-2-1〜2:バックファイアＥスマッシャー、CG5-4:夜空に浮かぶグリーペン |
| 文化祭の話、ジュラーブリク捕まる | 自動 | 「テロリストの残党に襲われる」の25ターン後 →アマネカとレンザン以外離脱 →オウール街の迷宮に入れるようになる →オウール街以外に着くと旧校舎に戻される |
| 五章・ジュラーブリク救出 | オウール街の迷宮クリア時 | 「文化祭の話、ジュラーブリク捕まる」の後 |
| 警官に呼び止められるアマネカ | 帝国ジュニアアカデミー旧校舎以外に到着時 | 「ジュラーブリク救出」の後、「ジュラーブリクを旧校舎にかくまう」の前 何処で発生しても背景が新校舎になっている |
| ジュラーブリクを旧校舎にかくまう | 帝国ジュニアアカデミー旧校舎に到着時 | 「ジュラーブリク救出」の後 |
| アマネカとパシ研メンバーの反目 | 帝国ジュニアアカデミー新校舎に到着時 | 「ジュラーブリクを旧校舎にかくまう」の後 CG6-3:レンザンの上で落ち込むアマネカ →カル復帰 |
| アマネカCTUに連行される | 帝国ジュニアアカデミー旧校舎に到着時 | 「アマネカとパシ研メンバーの反目」の後 CG5-4:夜空に浮かぶグリーペン、CG1-2:高笑いアマネカ →全員復帰 |
| CTUの抗議 | 自動 | 「アマネカCTUに連行される」の25ターン後 →レンザン、ソードフィッシュ、ミズモ、ズイウン離脱 |
| アカデミー文化祭 | 自動 | 「CTUの抗議」の25ターン後 CG2-3:パシ研ヤキソバ屋 →イサーク街にゾーンダース財団出現 →官庁街、セントラルステーション、海底遺跡の迷宮に入れるようになる |
| 秘宝奪取失敗 | 自動/侵入される | 「アカデミー文化祭」の75ターン後かつ「オルカレイコスの心臓発動」前、もしくはゾーンダース財団が官庁街、セントラルステーション、海底遺跡の何れかに侵入する →ゲームオーバー |
| 官庁街の秘宝奪取作戦開始 | 官庁街の迷宮に入る時 | 「アカデミー文化祭」の後 |
| 官庁街の秘宝を奪取 | 官庁街の迷宮クリア時 | 「アカデミー文化祭」の後 →オルカレイコスの心臓・蒼入手 迷宮で手に入るのは碧だがイベントでは蒼 |
| セントラルステーションの秘宝奪取作戦開始 | セントラルステーションの迷宮に入る時 | 「アカデミー文化祭」の後 |
| セントラルステーションの秘宝を奪取 | セントラルステーションの迷宮クリア時 | 「アカデミー文化祭」の後 →オルカレイコスの心臓・碧入手 迷宮で手に入るのは蒼だがイベントでは碧 |
| 海底遺跡の秘宝奪取作戦開始 | 海底遺跡の迷宮に入る時 | 「アカデミー文化祭」の後 |
| 海底遺跡の秘宝を奪取 | 海底遺跡の迷宮クリア時 | 「アカデミー文化祭」の後 →オルカレイコスの心臓・紅入手 |
| オルカレイコスの心臓発動 | 自動 | 「官庁街の秘宝を奪取」「セントラルステーションの秘宝を奪取」「海底遺跡の秘宝を奪取」全てを見た次のターン CG5-3-1〜2:レンザンＥスマッシャー →イサーク街の迷宮に入れる様に |
| ゾーンダースのアジトに突入 | イサーク街に到着時 | 「オルカレイコスの心臓発動」の後 |
| ゾーンダースのアジト壊滅 | イサーク街の迷宮クリア時 | 「オルカレイコスの心臓発動」の後 →ゾーンダース財団消滅 |
| ボードゲームで遊ぶパシ研 | 自動 | 「ゾーンダースのアジト壊滅」の25ターン後 |
| 万博会場襲われる | Ｅアイランドに到着時 | 「ボードゲームで遊ぶパシ研」後、「ブリーフィング15」まで何度でも起こる CG5-1:バックファイア出現 →旧校舎に戻される |
| 万博会場への抜け道を教わる | グレイチャペル街に到着時 | 「万博会場襲われる」の後 →資財搬入路入口が探索できるようになる →資財搬入路入口の迷宮に入れるようになる |
| 資材搬入路発見 | 資材搬入路入口を発見時 | |
| 万博会場への突入路確保 | 資材搬入路入口の迷宮クリア時 | |
| ブリーフィング15:ゾーンダース殱滅作戦 | 自動 | 「万博会場への突入路確保」の次のターン CG1-3-13:ブリーフィング15-ゾーンダース殱滅作戦 →Ｅアイランドの迷宮に入れるようになる |
| 万博会場突入直前 | Ｅアイランドに到着時 | 「ブリーフィング15」の後 |
| 熱爆弾炸裂、ゾーンダース宇宙へ | Ｅアイランドの迷宮クリア時 | 「ブリーフィング15」の後 ４章で熱爆弾が完成していなくてもよい |
| ゾーンダースからの最終通告 | 自動 | 「熱爆弾炸裂、ゾーンダース宇宙へ」の25ターン後 CG3-3:エアナとカルの胸を同時に揉むアマネカ |
| ゾーンダース旅立つ | 自動 | 「ゾーンダースからの最終通告」の50ターン後、「ゾーンダースとの最終決戦」の前 →ゲームオーバー |
| ゾーンダースとの最終決戦 | 帝国ジュニアアカデミー新校舎に到着時 | 「ゾーンダースからの最終通告」の後 CG1-3-13:ブリーフィング-ゾーンダース殱滅作戦、CG5-5:レンザンロケットに乗り込むアマネカ、CG7-3-1〜4:レンザンロケットを操縦するアマネカ、CG6-4:アマネカ宇宙へ、CG6-5:レンザンロケット全景、CG5-3-1〜3:レンザンＥスマッシャー、CG7-2-1〜3:ファイナルＥスマッシャー、CG7-4:カルとアルパーに救出されるアマネカ →エンディング CG6-6:空から降りてくるアマネカ、CG6-7:出迎えるパシ研部員 |